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捷鼎国际全闪存阵列推进基因组学数据分析

2017-12-29 15:56来源:中国存储网
导读:NeoSapphire全 NVMe 闪存阵列加速亚大基因科技公司的生物信息分析解决方案的结果时间。

软件定义全闪存存储产品供货商捷鼎国际 (AccelStor) 针对科学家、研究人员和工程师的高效能运算 (HPC; High Performance Computing) 应用,即将推出全新 NeoSapphire全 NVMe 闪存阵列。NeoSapphire 全 NVMe 闪存阵列的高性能、出色的数据吞吐量和低延迟特色使其成为高效运算应用的理想存储解决方案,例如基因组学、化学工程运算和工程仿真运算。这款存储解决方案已经在亚大基因科技 (Atgenomix) 的企业级生物信息分析 (Bioinformatics) 应用中获得验证,该解决方案提供一个可靠的基因定序数据平台,研究人员可以利用他们所需的任何工具快速且简单的获得基因组的分析结果。

由于基因组测序在分析时会产生巨量的数据,亚大基因科技提供创新的分布式基因定序分析平台,将复杂的基因体研究检测简化为适合研究人员使用的运算环境,为了加速标准分析流程,亚大基因科技采用 NeoSapphire 全闪存阵列来快速扩充分析基因组模拟算法所需的存储工作量。亚大基因科技利用 Apache Spark 作为基因组数据分析的丛集计算平台,这种高效运算应用程序需要高速网络、高效能的储存系统、大容量的内存与并行计算能力。一些高效丛集运算框架使用双 CPU设计 和内部硬盘的服务器,这种系统架构虽能提供足够的计算能力,但往往存在 I/O 存取瓶颈,并且会拖延整个最后计算结果的时间。藉由捷鼎国际的 NeoSapphire 存储解决方案,亚大基因科技及其客户能够更快、更经济地缩短基因组数据分析所需要的计算时间。

为了解决科学研究与其他高效运算应用中的效能瓶颈,捷鼎国际的 FlexiRemap® 软件技术把计算节点所产生的动态数据平行写入储存系统这种方式根本性的消除 I/O 存取瓶颈,可快速满足高效运算在各种不同应用领域的需求,亦不需要增加昂贵的计算节点设备。高效运算应用中大多数的 I/O 密集型需求,必须将整个模拟计算不断与之前的演算检查点进行比较,而临床实验中的基因组研究就是一个很好的案例。

亚大基因科技股份有限公司执行长暨共同创办人张明台表示:「Atgenomix SeqsLab 的企业级丛集计算能够在整个基因组和外显子组的分析中提供多个数量级的加速性能,与捷鼎国际的 NeoSapphire 高效能平行存储设备整合可大幅提高 3 倍数据处理的速度,这个卓越的结果可为我们的客户提供一个完整、可靠且可扩展的基因组信息分析平台。」

捷鼎国际美国总经理余人仰表示:「存储性能和 IT 基础设施的表现已经成为企业和研究组织在业务模式上的明显竞争优势。捷鼎国际希望在各行各业中提供创新的高效能运算存储解决方案。藉由捷鼎国际的 NeoSapphire 全闪存阵列,企业和科学家将能够快速提供研究结果,最大限度地处理数据量,并让企业与科学家们获得更多的业务机会与创新的科学发现。」

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