2020-06-08 22:07:47
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XSEDE是一种极端科学和工程发现环境,它使美国各地的科学家和研究人员可以自由访问一些可用于各种学科的最强大的计算资源。

上接第一部分:InsideHPC特别报告:基因组学时代的HPC和AI(一)

新冠肺炎

截至2020年3月,美国政府已成立一个财团,向研究人员提供一些世界上最强大的系统,以了解COVID-19病毒,并在开发疫苗方面取得进展。来自许多学科的科学家将利用超过750,000个内核获得数百petaflops的计算能力。HPC和AI技术的结合加快了疫苗或治愈可能寻求的分子的可能性和虚拟测试。没有可用的计算能力和数据存储能力,这个过程将大大延迟疫苗或治疗的引入。

通过该财团可获得的前沿计算,网络和数据存储资源可以处理与生物信息学,流行病学和分子建模有关的广泛模拟。与之前几周到几个月的时间相比,科学家可以在几小时或几天内研究可能的化学组合。XSEDE是一种极端科学和工程发现环境,它使美国各地的科学家和研究人员可以自由访问一些可用于各种学科的最强大的计算资源。最近,XSEDE已加入HPC联盟进行COVID-19研究。圣地亚哥超级计算机中心是XSEDE的成员,并致力于在大型系统和存储系统设计方面的专业知识,以应对COVID-19。

“美国正携手抗击COVID-19,这意味着释放我们世界一流的超级计算机的全部功能,以迅速推进治疗和疫苗的科学研究。我们感谢作为特朗普政府对整个美国的回应之一而加入联邦政府的私营部门和学术领袖。”美国首席技术官Michael Kratsios说道。

对组织的好处

除了将给有针对性的诊断和治疗的个人带来好处之外,实施或推动这一事业的组织也可以期待许多好处。

革新

可以提供对最新系统的远程访问的IT部门可以加速新发现。研究人员可以专注于自己的科学研究,而不必深入研究IT问题。精心设计和调整良好的体系结构有助于最终用户轻松访问HPC资源,并使IT组织的维护和支持更加轻松。

领导

更好地利用其领先的IT基础架构的组织为新的赠款或其他资金来源吸引了更多机会,并提高了招募新研究人员的能力。先进的设施,包括最新的计算和存储系统,使研究人员可以使用最新工具集中精力进行研究。对使用现代IT基础架构抱有信心的组织可以反过来以最佳实践帮助他人,并洞察如何利用其他机会。

患者结果

直接与患者合作的组织可以证明和量化更好的患者结果,不仅可以帮助患者,而且可以随着时间的推移提高组织对数据的可见性。在个性化医疗中使用最新技术可以为患者带来更好的结果,从而提高了所有竞争组织的门槛。

由于精密医学可以根据个体症状和诊断进行治疗,因此误诊的可能性较小,而罕见疾病的治疗方法也更多。(罕见儿童疾病中心(Center for Rare Childhood Diseases)定义,在1万人口中,罕见病的人数少于5。

使能

研究人员通常是所有可用计算能力,网络和存储容量的使用者。当有更好的解决方案可供他们使用时,可以执行更完整的模拟,并且可以模拟更多的结果。这不仅可以做出更个性化的决策,还可以使许多领域的专家推动科学发展。先进的技术使临床医生可以处理大量数据,创建更现实的模型并为个人确定更好的治疗途径。这也可能导致与各种组织共享信息和见解。

继续阅读第三部分:insideHPC特别报告:基因组学时代的HPC和AI(三)

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