2015-07-17 22:56:38
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Hadoop
讲述如何将Hadoop与现有的数据库结合起来,在Hadoop应用程序中访问数据库中的文件。DBInputFormat和DBOutputFormat提供了一个访问数据库的简单接口,虽然接口简单,但应用广泛。

Hadoop主要用来对非结构化或半结构化(HBase)数据进行存储和分析,而结构化的数据则一般使用数据库来进行存储和访问。本文的主要内容则是讲述如何将Hadoop与现有的数据库结合起来,在Hadoop应用程序中访问数据库中的文件。

1.DBInputFormat

DBInputFormat是Hadoop从0.19.0开始支持的一种输入格式,包含在包org.apache.hadoop.mapred.lib.db中,主要用来与现有的数据库系统进行交互,包括MySQL、PostgreSQL、Oracle等几个数据库系统。DBInputFormat在Hadoop应用程序中通过数据库供应商提供的JDBC接口来与数据库进行交互,并且可以使用标准的SQL来读取数据库中的记录。在使用DBInputFormat之前,必须将要使用的JDBC驱动拷贝到分布式系统各个节点的$HADOOP_HOME/lib/目录下。

在DBInputFormat类中包含以下三个内置类:

1.protected class DBRecordReader implements RecordReader<LongWritable, T>:用来从一张数据库表中读取一条条元组记录。

2.public static class NullDBWritable implements DBWritable, Writable:主要用来实现DBWritable接口。

3.protected static class DBInputSplit implements InputSplit:主要用来描述输入元组集合的范围,包括start和end两个属性,start用来表示第一条记录的索引号,end表示最后一条记录的索引号。

其中DBWritable接口与Writable接口比较类似,也包含write和readFields两个函数,只是函数的参数有所不同。DBWritable中的两个函数分别为:

public void write(PreparedStatement statement) throws SQLException;

public void readFields(ResultSet resultSet) throws SQLException;

这两个函数分别用来给java.sql.PreparedStatement设置参数,以及从java.sql.ResultSet中读取一条记录,熟悉Java JDBC用法的应该对这两个类的用法比较了解。

2.使用DBInputFormat读取数据库表中的记录

上文已经对DBInputFormat以及其中的相关内置类作了简单介绍,下面对怎样使用DBInputFormat读取数据库记录进行详细的介绍,具体步骤如下:

1.使用DBConfiguration.configureDB (JobConf job, String driverClass, String dbUrl, String userName, String passwd)函数配置JDBC驱动,数据源,以及数据库访问的用户名和密码。例如MySQL数据库的JDBC的驱动为“com.mysql.jdbc.Driver”,数据源可以设置为“jdbc:mysql://localhost/mydb”,其中mydb可以设置为所需要访问的数据库。

2.使用DBInputFormat.setInput(JobConf job, Class<? extends DBWritable> inputClass, String tableName, String conditions, String orderBy, String... fieldNames)函数对要输入的数据进行一些初始化设置,包括输入记录的类名(必须实现了DBWritable接口)、数据表名、输入数据满足的条件、输入顺序、输入的属性列。也可以使用重载的函数setInput(JobConf job, Class<? extends DBWritable> inputClass, String inputQuery, String inputCountQuery)进行初始化,区别在于后者可以直接使用标准SQL进行初始化,具体可以参考Hadoop API中的讲解。

3.按照普通Hadoop应用程序的格式进行配置,包括Mapper类、Reducer类、输入输出文件格式等,然后调用JobClient.runJob(conf)。

3.使用示例

假设MySQL数据库中有数据库school,其中的teacher数据表定义如下:

DROP TABLE IF EXISTS `school`.`teacher`;

CREATE TABLE  `school`.`teacher` (

  `id` int(11) default NULL,

  `name` char(20) default NULL,

  `age` int(11) default NULL,

  `departmentID` int(11) default NULL

) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=latin1;

首先给出实现了DBWritable接口的TeacherRecord类:

public class TeacherRecord implements Writable, DBWritable{

      int id;

      String name;

      int age;

      int departmentID;

     

      @Override

      public void readFields(DataInput in) throws IOException {

             // TODO Auto-generated method stub

             this.id = in.readInt();

             this.name = Text.readString(in);

             this.age = in.readInt();

             this.departmentID = in.readInt();

      }

      @Override

      public void write(DataOutput out) throws IOException {

             // TODO Auto-generated method stub

             out.writeInt(this.id);

             Text.writeString(out, this.name);

             out.writeInt(this.age);

             out.writeInt(this.departmentID);

      }

      @Override

      public void readFields(ResultSet result) throws SQLException {

             // TODO Auto-generated method stub

             this.id = result.getInt(1);

             this.name = result.getString(2);

             this.age = result.getInt(3);

             this.departmentID = result.getInt(4);

      }

      @Override

      public void write(PreparedStatement stmt) throws SQLException {

             // TODO Auto-generated method stub

             stmt.setInt(1, this.id);

             stmt.setString(2, this.name);

             stmt.setInt(3, this.age);

             stmt.setInt(4, this.departmentID);

      }

      @Override

      public String toString() {

             // TODO Auto-generated method stub

             return new String(this.name + " " + this.age + " " + this.departmentID);

      }

}

利用DBAccessMapper读取一条条记录:

public class DBAccessMapper extends MapReduceBase implements

Mapper<LongWritable, TeacherRecord, LongWritable, Text> {

      @Override

      public void map(LongWritable key, TeacherRecord value,

                    OutputCollector<LongWritable, Text> collector, Reporter reporter)

                    throws IOException {

             // TODO Auto-generated method stub

collector.collect(new LongWritable(value.id),

 new Text(value.toString()));

      }

     

}

Main函数如下:

public class DBAccess {

      public static void main(String[] args) throws IOException {

             JobConf conf = new JobConf(DBAccess.class);

             conf.setOutputKeyClass(LongWritable.class);

             conf.setOutputValueClass(Text.class);

             conf.setInputFormat(DBInputFormat.class);

             FileOutputFormat.setOutputPath(conf, new Path("dboutput"));

            

             DBConfiguration.configureDB(conf,"com.mysql.jdbc.Driver",

                        "jdbc:mysql://localhost/school","root","123456");

             String [] fields = {"id", "name", "age", "departmentID"};

             DBInputFormat.setInput(conf, TeacherRecord.class, "teacher",

                        null, "id", fields);

            

             conf.setMapperClass(DBAccessMapper.class);

             conf.setReducerClass(IdentityReducer.class);

            

             JobClient.runJob(conf);

      }

}

该示例从teacher表中读取所有记录,并以TextOutputFormat的格式输出到dboutput目录下,输出格式为<”id”, “name age departmentID”>。

4.使用DBOutputFormat向数据库中写记录

DBOutputFormat将计算结果写回到一个数据库,同样先调用DBConfiguration.configureDB()函数进行数据库配置,然后调用函数DBOutputFormat.setOutput (JobConf job, String tableName, String... fieldNames)进行初始化设置,包括数据库表名和属性列名。同样,在将记录写回数据库之前,要先实现DBWritable接口。每个DBWritable的实例在传递给Reducer中的OutputCollector时都将调用其中的write(PreparedStatement stmt)方法。在Reduce过程结束时,PreparedStatement中的对象将会被转化成SQL语句中的INSERT语句,从而插入到数据库中。

5.总结

DBInputFormat和DBOutputFormat提供了一个访问数据库的简单接口,虽然接口简单,但应用广泛。例如,可以将现有数据库中的数据转储到Hadoop中,由Hadoop进行分布式计算,通过Hadoop对海量数据进行分析,然后将分析后的结果转储到数据库中。在搜索引擎的实现中,可以通过Hadoop将爬行下来的网页进行链接分析,评分计算,建立倒排索引,然后存储到数据库中,通过数据库进行快速搜索。虽然上述的数据库访问接口已经能满足一般的数据转储功能,但是仍然存在一些限制不足,例如并发访问、数据表中的键必须要满足排序要求等,还需Hadoop社区的人员进行改进和优化。

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